Le réseau des instituts de recherche en Afrique du Nord et au Moyen-Orient comprend :
Institut français du Proche-Orient - Ifpo - Damas, Beyrouth, Amman, Alep
Centre d'études et de documentation économiques, juridiques et sociales - Cedej - Le Caire
Centre français d'archéologie et de sciences sociales de Sanaa - Cefas - Sanaa
Centre Jacques Berque - CJB - Rabat
Institut de recherche sur le Maghreb contemporain - Irmc - Tunis
